Pētnieki sniedz jaunus datus par genoma trīsdimensiju struktūru

Pirmdiena, 2013. gada 24. jūnijs. Austrālijas un ASV zinātnieki sniedz jaunas zināšanas, lai izprastu genoma trīsdimensiju struktūru, kas ir viens no lielākajiem izaicinājumiem, ar ko saskaras genomikas un ģenētika, kura secinājumi tiek publicēti tā digitālajā izdevumā Dabas ģenētika ”.

Apmēram trīs metri DNS ir cieši salocīti katras mūsu ķermeņa šūnas kodolā, kas ļauj dažiem gēniem "izteikties" vai aktivizēties, izslēdzot citus. Ārsti Tims Merceris un Džons Matiks no Garvānas Medicīnisko pētījumu institūta Sidnejā un profesors Džons Stamatoyannopoulos no Vašingtonas universitātes Sietlā ar augstu izšķirtspēju analizēja genoma 3D struktūru.
Gēni sastāv no "eksoniem" un "introniem", no kuriem pirmie ir secības, kas kodē un ekspresē olbaltumvielas, un pēdējie - nekodētā DNS stiepjas barotnē. Kopējot vai transkribējot gēnus, no DNS RNS, intronu sekvences tiek sagrieztas vai "sašķeltas", un atlikušie eksoni tiek savienoti kopā, veidojot secību, kas kodē olbaltumvielu. Atkarībā no eksoniem, kas ir šķībi, viens un tas pats gēns var radīt dažādas olbaltumvielas.
Izmantojot lielu datu daudzumu no ENCODE projekta, doktors Tims Merceris un viņa kolēģi ir secinājuši genoma kropļošanu, secinot, ka pat gēnā atlasītie eksoni ir viegli pakļauti. "Iedomājieties garu un ārkārtīgi sarežģītu vīnogulāju, tā savīti zari, kas satur dažas vīnogas, kuras var viegli noārdīt, vienlaikus paslēpjot citas nepieejamā vietā, " viņš rāda piemēru. Mercer
"Tajā pašā laikā iedomājieties slinku augļu savācēju, kurš tikai novāks vīnogas pa rokai, - viņš piebilst -. Tas pats princips attiecas uz genomu. Specifiski gēni un pat specifiski eksoni ir saliekamā attālumā." Šajā ziņā šis pētnieks norāda, ka pēdējos gados zinātnieki ir sākuši novērtēt, kā genoma locīšana palīdz noteikt, kā tā tiek izteikta un regulēta.
"Šis pētījums sniedz pirmās norādes, ka genoma trīsdimensiju struktūra var ietekmēt gēnu sašķelšanos. Mēs varam secināt, ka genoms saliecas tādā veidā, ka promotora reģions, secība, kas ierosina gēna transkripciju, ir atrasti blakus eksoniem, un viņi visi tiek nogādāti transkripcijas mašīnās, "viņš uzsver.
"Tas atbalsta jaunu lietu skatīšanas veidu, ka genoms lokās ap transkripcijas mašīnām, nevis otrādi. Tie gēni, kas nonāk saskarē ar transkripcijas mašīnām, iegūst kopijas, bet daļas, kas orbītas tālu prom tie tiek ignorēti, "secina šis pētnieks.
Avots: www.DiarioSalud.net